Le critère de ce classement est simple : ce que le plan gratuit couvre pour un auto-entrepreneur sans sortir la carte bancaire. On regarde d’abord l’émission et la réception par une plateforme agréée, sans plafond de factures, puis les outils dont une micro-entreprise a besoin chaque mois (livre des recettes, relances, envoi), enfin les conditions d’accès (statut, compte à ouvrir). À égalité, le prix de la première formule payante départage. Skoqo ne teste pas l’ergonomie des logiciels : il compare des prix et des conditions, relevés le 15 octobre 2026.
Le calendrier : ce qui est déjà obligatoire
La réforme a deux étages. Depuis le 1er septembre 2026, votre micro-entreprise doit pouvoir recevoir des factures électroniques par une plateforme agréée, même en franchise de TVA. L’émission et la transmission des données suivent un an plus tard.
Facturation électronique : les deux dates d'une micro-entreprise
Date annoncée
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Septembre2026
- 1er sept. Réception obligatoire pour toutes les entreprises Micro-entreprises comprises, même sans TVA. Sans plateforme agréée : mise en demeure de 3 mois, puis 500 € d'amende.
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Décembre2026
- 20 déc. Abby Fin de la promotion d'automne Start à 8,10 € HT par mois en annuel au lieu de 9 €, pour qui veut déjà un plan payant.
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Septembre2027
- 1er sept. Émission et e-reporting obligatoires pour les PME et micro-entreprises 50 € par facture non électronique, 15 000 € au plus par an.
Il n’y a pas de portail gratuit de l’État : l’administration a renoncé à ce projet et renvoie vers les plateformes privées qu’elle immatricule. Une « solution compatible » qui n’est pas sur la liste doit passer par l’une d’elles. C’est le cas de Freebe, écarté ici faute de formule gratuite.
Ce que coûte la suite, une fois le gratuit dépassé
Les sept formules gratuites suffisent pour facturer. On paie le jour où l’on veut un compte pro complet, des relances automatiques ou des déclarations préparées par l’outil. Sur un an, la première marche payante se tient dans un mouchoir de poche.
Un an de la première formule payante, pour un auto-entrepreneur
en € HT par an
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Pennylane Starter Compte Pro requis
84 €
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Abby Start 97,20 € la 1re année avec AUTUMNSALES
108 €
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Indy Plus 12 € HT par mois sans engagement
108 €
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Shine Start Compte pro, 30 virements par mois
108 €
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Qonto Basic Compte pro, 30 virements par mois
108 €
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Tiime Initial Après 2 mois d'essai, compte pro Tiime
119,88 €
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Indy Autonomie Avec les déclarations Urssaf et TVA
180 €
L’écart entre les formules d’entrée ne dépasse pas 36 € HT par an. Ce qui change la note, c’est le moment où l’on veut que l’outil prépare les déclarations : Indy Autonomie à 180 € HT par an pour un auto-entrepreneur. Les autres formules sont détaillées dans notre comparatif Indy, Tiime, Pennylane ou Abby. Le coût annuel réel d’un logiciel comptable auto-entrepreneur, Freebe et Dougs compris, a sa propre page. Pour profiter d’un avantage de bienvenue, choisissez avant de vous inscrire : le lien d’un parrain ou d’un partenaire ne s’ajoute pas après coup chez Indy, Tiime ou Pennylane.
Notre conseil, statut par statut
En micro-entreprise, à votre place, on ouvrirait Tiime Free ou Abby Basique dès maintenant pour recevoir les factures de ses fournisseurs. On garderait un an pour s’habituer à l’émission. Si vous n’avez pas encore de compte dédié à votre activité, Indy Essentiel ou Shine Free règlent les deux questions d’un coup. Pennylane Free tient la route tant que vous restez sous 100 factures par mois et que vous ne changez pas de statut. En société, Dougs et les offres ouvertes à tous évitent de payer un logiciel avant d’avoir choisi un comptable.
Dernier réflexe : vérifiez que votre outil figure sur la liste des plateformes agréées publiée par impots.gouv.fr. Une banque ou un logiciel qui annonce une facturation « conforme » sans y figurer doit passer par une plateforme agréée : demandez laquelle avant de vous inscrire.